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2.6: Asignaciones con muestras - Biología


Las asignaciones de este curso tienen licencia abierta y están disponibles tal cual, o pueden modificarse para adaptarse a las necesidades de sus estudiantes.

Este curso proporciona 10 indicaciones y rúbricas de calificación para tareas escritas, diseñadas para alinearse con los resultados del curso.

Si importa este curso a su gestión de aprendizaje (Blackboard, Canvas, etc.), las tareas se cargarán automáticamente en la herramienta de tareas. Puede verlos a continuación o durante todo el curso.

Archivos de asignaciónAlineación del módulo
Astronauta biológico (descargue el .docx, .rtf)Después de ambos, Módulo 1: Introducción a la biología y Módulo 2: Química de la vida
Nutricionista por un día (descargue el .docx, .rtf)
Ejemplo de tarea completada para distribuir a los estudiantes
Después del Módulo 3: Macromoléculas biológicas importantes
Cell Builder (descargue el .docx, .rtf)
A continuación, se muestra un ejemplo de lo que pueden crear los estudiantes.
Después del Módulo 4: Estructura celular
¡Membranas Vivas! (descargue el .docx, .rtf)
Ejemplo de tarea completada para distribuir a los estudiantes
Después del Módulo 5: Membranas celulares
Observación de transacciones de energía (descargue el .docx, .rtf)
A continuación, se muestra un ejemplo de lo que pueden crear los estudiantes.
Después del Módulo 6: Vías metabólicas
Misiones de Internet sobre mitosis y meiosis (descargue el .docx, .rtf)
Vea este ejemplo de lo que los estudiantes pueden enviar
Después del Módulo 7: División celular
¿Cuál tiene más ADN? (descargue el .docx, .rtf)
Vea los ejemplos contenidos aquí
Después del Módulo 8: Estructura y replicación del ADN
Cómo funcionan las mutaciones (descargue el .docx, .rtf)
Este documento muestra un envío de ejemplo
Tenga en cuenta que solo incluye respuestas a algunas preguntas y una única instantánea para darle una idea de cómo completar esta tarea.
Después de ambos, Módulo 9: Transcripción de ADN, Módulo 10: Traducción y Módulo 11: Expresión genética
Dragon Genetics (descargue el .docx, .rtf)
Aquí hay un ejemplo trabajado que muestra una captura de pantalla y una explicación de texto requerida
Módulo 12: Después de la herencia de rasgos
¡Cuando los Jabberjays atacan! (descargue el .docx, .rtf)
Documento de sugerencias para distribuir a los estudiantes
Después del Módulo 13: Teoría de la evolución y del Módulo 14: Biología moderna

Asignaciones

Por cada tercio del curso, se asignará un artículo de investigación relacionado con el material tratado en la conferencia. Todo el mundo debe leer estos artículos, se discutirán en la recitación y pueden aparecer preguntas relacionadas en los exámenes. Con cada artículo, también entregaremos una pregunta de discusión. Se anima a los estudiantes a escribir un ensayo breve (2 páginas a doble espacio) en respuesta a esta pregunta. Los ensayos recibirán hasta 15 puntos y se calificarán en función de la integridad de la respuesta, la claridad de la explicación y la originalidad. Si bien las calificaciones de los cursos se calcularán exclusivamente en función de las calificaciones de los exámenes, los puntos acumulados al completar las tareas de escritura se agregarán a los totales del examen. Luego, las calificaciones se asignarán sin alterar los totales de puntos correspondientes a cada calificación de letra. Por lo tanto, las tareas de redacción se tratarán como crédito adicional.

Las respuestas a las preguntas de discusión deben ser en forma de un ensayo de 2 páginas con Título, a doble espacio, usando tamaño de fuente 12 con márgenes de una pulgada en la parte superior, inferior, izquierda y derecha. Todos los trabajos deben dejarse justificados. ¡No hay excusas! El ensayo debe resumir los puntos importantes del trabajo que pertenecen a la pregunta (no más de dos párrafos) y proponer una respuesta a las preguntas planteadas. La calidad de la respuesta dependerá de la calidad de los argumentos de apoyo, así como de la calidad de la presentación.

El artículo de Chong y sus colegas describe la purificación y caracterización de una proteína arqueobacteriana (MtMcm) que está relacionada con las proteínas eucariotas Mcm. Los experimentos de la figura 1 indican que MtMcm tiene un sitio de unión tanto para el ssDNA como para el dsDNA. Es posible que estos ADN se unan al mismo sitio en la proteína o que se unan a sitios separados. Proponga un experimento para distinguir entre estas dos posibilidades y describa los resultados que esperaría si el dsDNA y el ssDNA comparten el mismo sitio de unión. Si el ssDNA y dsDNA comparten el mismo sitio de unión, ¿qué parte del ADN es más probable que esté involucrada en la interacción que estimula la ATPasa?

Para abordar la capacidad de la proteína MtMcm para desplazar grandes fragmentos de ADN, los autores crearon un sustrato de helicasa de ADN con ssDNA de longitud variable (25 a 500 bases) hibridados en un gran círculo de ssDNA y encontraron que MtMcm puede desplazar ssDNA hasta 500 bases. ¿Es este un ensayo para la procesividad de MtMcm? Explica por qué o por qué no.

El artículo de Yang y sus colegas describe la caracterización del homólogo de BRCA2, Brh2. Proporcionan evidencia de que Brh2 promueve el ensamblaje del filamento Rad51 y que este papel podría explicar cómo funcionan las proteínas BRCA2 en la reparación de DSB.

Los ensayos de recombinación descritos en el documento requieren la proteína de unión a ADN monocatenario RPA. Explique los múltiples efectos que se cree que tiene la RPA en el ensamblaje del filamento Rad51. En un experimento, los autores utilizan E. coli SSB en lugar de RPA. ¿Cuál es el papel de este experimento en la lógica del artículo?

Los autores también concluyen que Brh2 promueve preferentemente la formación de filamentos Rad51 en las uniones ssDNA-dsDNA. Además, infieren que estos filamentos crecen específicamente para cubrir el saliente de ADN de 3. ¿Cómo diferirían sus resultados si no se hubiera observado esta polaridad específica de crecimiento de filamentos? Sugieren a partir de su trabajo estructural que esta polaridad podría deberse a la nucleación por Rad51 unido a BRC. ¿Encuentra este modelo atractivo, poco atractivo o innecesario? Explique su posición sobre este tema.

Ibrahim, el C., T. D. Schaal, K. J. Hertel, R. Reed y T. Maniatis. & quot; Supresión dependiente de proteínas ricas en serina / arginina de la omisión de exón mediante potenciadores de empalme exónico & quot ;. Proc Natl Acad Sci EE. UU. 102, no. 14 (5 de abril de 2005): 5002-7. (Epub 7 de marzo de 2005)

El artículo de Ibrahim et al. aborda los mecanismos empleados para asegurar el emparejamiento adecuado de los sitios de empalme de 5 'y 3'. Los autores llegan a dos conclusiones distintas: (1) que las proteínas SR, al unirse a exones no empalmados, dirigen la maquinaria de empalme a los sitios de empalme 5 'y 3' más cercanos (2) las proteínas SR funcionan para suprimir el empalme entre los sitios de empalme 5 'aguas arriba y sitios de empalme 3 'aguas abajo. Resuma la evidencia que apoya específicamente la segunda de estas conclusiones.

En los pre-ARNm que llevan varios exones alternativos (por ejemplo, un gen con 4 exones, pero 3 versiones alternativas del exón 2 que se utilizan en diferentes tejidos), la elección del sitio de corte y empalme tiene complejidades adicionales. Con base en las conclusiones de este trabajo, proponga un modelo de cómo se podría lograr un empalme alternativo en los diferentes tejidos. Puede incluir una figura si lo desea, además de las 2 páginas de texto escrito.


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