Información

Vinculación cis y trans


Pregunta:

Dos genes no alélicos dominantes están separados por 50 unidades de mapa, el enlace es:

(A) Tipo cis

(B) Tipo trans

(C) Completo

(D) Ausente / Incompleto

Mi toma:

Después de muchas búsquedas en la red, encontré que 50 unidades de mapa = 50% de frecuencia de recombinación. Y no ocurre ninguna recombinación cuando hay 50 unidades de mapa o más. Pero no se proporciona información sobre la vinculación cis y trans con la de las unidades de mapa. Aunque la respuesta a la pregunta anterior está ausente o incompleta (d), las opciones me molestaron para hacer esta pregunta

¿Es posible adivinar el enlace cis / trans cuando se dan las unidades de mapa? Si me equivoco, corrígeme. Gracias por adelantado !


Vinculación cis y trans - Biología

Recombinación en loci no enlazados vs cis - y amp trans - enlazados

Loci desvinculado versus vinculado

Por lo general, en un cruce que involucra dos loci A y B no vinculados

Cruz # 1:
AABB x aabb (P) AaBb (F1) [doble heterocigoto]
AaBb x aabb (cepa del probador)

B1
Genotipos
fenotipo
contar
recombinante
escribe
AB ab
'AB'
250
De los padres
Ab ab 'Ab'
250
Recombinante
aB ab 'aB'
250
Recombinante
ab ab 'ab'
250
De los padres

El uso del "probador" asegura que los fenotipos de B 1
están determinados por el genotipo de los gametos del dihíbrido
y se detectan fácilmente mediante la inspección del fenotipo

Recombinantes están el 50% del total de loci desvinculados

Pero podemos hacer un heterocigoto doble mediante dos cruces diferentes.
Primero, suponga

Cruz # 2:
AABB x aabb AaBb

AaBb x aabb (probador)

fenotipo
contar
recomb
escribe
'AB'
500
De los padres
'Ab'
0
Recombinante
'aB'
0
Recombinante
'ab'
500
De los padres

y

AaBb x aabb (probador)

fenotipo
contar
recomb
escribe
'AB'
0
Recombinante
'Ab'
500
De los padres
'aB'
500
De los padres
'ab'
0
Recombinante

Los loci "A" y "B" están vinculados (en el mismo cromosoma):

Cruz # 2: Alelos A y amp B en el mismo cromosoma --- o ------ A --- B ---
alelos a & amp b "" "--- o ------- a --- b ---

Cruz # 3: Alelos A y amp b vinculados --- o ------ A --- b ---
alelos a & amp B vinculados --- o ------ a --- B ---

Cruz # 2: AB / / AB x ab / / ab = & gt AB / / ab [llamar a esta fase cis]
Cruz # 3: Ab / / Ab x aB / / aB = & gt Ab / / aB [llamar a esta fase trans]

En este ejemplo, "A" y "B" están completamente vinculados: 0% de recombinación

Normalmente, la frecuencia de recombinación (r) es 0% & lt r & lt 50%


Cálculo de la frecuencia de recombinación = distancia del mapa

AB // ab x ab // ab

fenotipo
contar
recomb
escribe
'AB'
400
De los padres
'Ab'
100
Recombinante
'aB'
100
Recombinante
'ab'
400
De los padres

Entonces, (100 + 100) / 1000 = 0,20 fracción de recombinación (r)
20% de frecuencia de recombinación (r.f.)
20 unidades de mapa (m.u.)
20 centimorgans (cM)

-o ------ A ------ 20 ------ B ------

Tarea : Explique los siguientes resultados, si D y E están completamente vinculados


Control cis y transmembrana de la topografía de la superficie celular

Las distribuciones topográficas de los componentes de la superficie celular pueden modificarse por perturbaciones del exterior de la membrana celular (efecto cis-membrana) o por perturbaciones del interior de la célula que se transfieren a través de la membrana (efecto transmembrana). Utilizando el fantasma de eritrocitos humanos como sistema modelo, los efectos de la membrana cis sobre la topografía de los sitios aniónicos se produjeron en fantasmas B + con sueros anti-B (pero no con anti-A), aglutinina de R. communis y concanavalina A (pero no con aglutinina de D. biflorus). El enlace cis-membrana se controló mediante el estado de agregación de las partículas de hidróxido de hierro coloidal unidas a la membrana que se unen casi exclusivamente a residuos de ácido N-acetilneuramínico sensibles a neuraminidasa en la superficie exterior. Se observaron efectos transmembrana cuando los anticuerpos purificados contra una proteína de la membrana de la superficie interna, la espectrina, se secuestraron dentro de los fantasmas. La antiespectrina secuestrada se unió a la espectrina en la superficie de la membrana interna y provocó la agregación de los sitios aniónicos en la superficie de la membrana externa. Los efectos transmembrana de la antiespectrina requerían anticuerpos γG intactos (Fab no los sustituía) y dependían del tiempo y la concentración.


7.5: Inferir recombinación a partir de datos genéticos

  • Contribuido por Todd Nickle e Isabelle Barrette-Ng
  • Profesores (biología) en Mount Royal University y amp University of Calgary

En los ejemplos anteriores, tuvimos la ventaja de conocer las posiciones cromosómicas aproximadas de cada alelo involucrado, antes de calcular las frecuencias de recombinación. Conocer esta información de antemano hizo que fuera relativamente fácil definir los genotipos parentales y recombinantes, y calcular las frecuencias de recombinación. Sin embargo, en la mayoría de los experimentos, no podemos examinar directamente los cromosomas, ni siquiera los gametos, por lo que debemos inferir la disposición de los alelos a partir de los fenotipos durante dos o más generaciones. Es importante destacar que, por lo general, no es suficiente conocer el genotipo de los individuos en una sola generación, por ejemplo, dado un individuo con el genotipo AaBb, no sabemos solo por el genotipo si los loci están ubicados en el mismo cromosoma y, de ser así, si la disposición de los alelos en cada cromosoma es AB y ab o Ab y aB (Figura ( PageIndex <6> )). La celda superior tiene los dos alelos dominantes juntos y los dos alelos recesivos juntos y se dice que tiene los genes en el acoplamiento (o cis) configuración. La alternativa que se muestra en la celda de abajo es que los genes están en el repulsión (o trans) configuración.

Figura ( PageIndex <6> ): Alelos en configuración de acoplamiento (arriba) o configuración de repulsión (abajo). (Original-Deyholos-CC: AN)

Afortunadamente para los genetistas, a veces se puede inferir la disposición de los alelos si se conocen los genotipos de una generación anterior. Por ejemplo, si los padres de AaBb tenía genotipos AABB y aabb respectivamente, entonces los gametos parentales que se fusionaron para producir AaBb hubiera sido genotipo AB y genotipo ab. Por lo tanto, antes de la meiosis en el dihíbrido, la disposición de los alelos también sería AB y ab (Figura ( PageIndex <7> )). Por el contrario, si los padres de AaBb tenía genotipos aaBB y AAbb, entonces la disposición de los alelos en los cromosomas del dihíbrido sería aB y Ab. Por lo tanto, el genotipo de la generación anterior puede determinar cuáles de los gametos de un individuo se consideran recombinantes y cuáles se consideran parentales.

Figura ( PageIndex <7> ): El genotipo de los gametos se puede inferir sin ambigüedades si los gametos son producidos por homocigotos. Sin embargo, las frecuencias de recombinación solo se pueden medir entre la progenie de heterocigotos (es decir, dihíbridos). Tenga en cuenta que el dihíbrido de la izquierda contiene una configuración diferente de alelos que el dihíbrido de la derecha debido a las diferencias en los genotipos de sus respectivos padres. Por lo tanto, los diferentes gametos se definen como recombinantes y parentales entre la progenie de los dos dihíbridos. En el cruce de la izquierda, los gametos recombinantes serán el genotipo AB y ab, y en el cruce de la derecha, los gametos recombinantes serán Ab y aB. (Original-Deyholos-CC: AN)

Consideremos ahora un experimento completo en el que nuestro objetivo es medir la frecuencia de recombinación (Figura ( PageIndex <8> )). Necesitamos al menos dos alelos para cada uno de los dos genes, y debemos saber qué combinaciones de alelos estaban presentes en los gametos parentales. La forma más sencilla de hacer esto es comenzar con líneas de reproducción pura que tengan alelos contrastantes en dos loci. Por ejemplo, podríamos cruzar ratones de cola corta, ratones marrones (aaBB) con ratones blancos de cola larga (AAbb). Según los genotipos de los padres, sabemos que los gametos parentales serán aB o Ab (pero no ab o AB), y toda la progenie serán dihíbridos, AaBb. No sabemos en este momento si los dos loci están en pares diferentes de cromosomas homólogos, o si están en el mismo cromosoma, y ​​si es así, qué tan cerca están.

Figura ( PageIndex <8> ): Un experimento para medir la frecuencia de recombinación entre dos loci. Los loci afectan el color del pelaje (B / b) y la longitud de la cola (A / a). (Deyholos-CC: AN modificado por Wikipedia)


Vinculación cis y trans - Biología

Los loci enlazados en el mismo cromosoma no se clasifican de forma independiente
Las proporciones genéticas de los gametos varían según lo cerca que se encuentren.

Los segmentos cromosómicos se intercambian físicamente entre cromátidas durante mitosis
Los quiasmas son indicaciones citológicas de cruces
Las hebras de ADN se rompen y se recombinan

La recombinación es proporcional a la distancia entre los loci
% de recombinación se puede utilizar para producir mapas de genes
Los cruces de prueba trihíbridos mapean tres loci simultáneamente
Mapas de recombinación son la columna vertebral de mapas de genoma completo

[Los resultados de los cruces genéticos se pueden evaluar estadísticamente
Ex. Prueba de chi-cuadrado de bondad de ajuste]

Los loci que ocurren en los cromosomas sexuales están ligados al sexo.
Los rasgos influidos por el sexo o limitados por el mismo no están necesariamente ligados al sexo:
p. ej., el cáncer de mama en mujeres se asocia con un locus autosómico BRCA1
La calvicie de patrón masculino y los ovarios poliquísticos pueden ser fenotipos alternativos

La recombinación entre loci ocurre de dos maneras
Loci desvinculados en cromosomas separados clasificar de forma independiente,
de acuerdo con las Reglas de Mendel (regla de producto)

Los loci enlazados en el mismo cromosoma tienden a agruparse

La recombinación ocurre por intercambio físico de material cromosómico [IG1 1 4 .11, 13 ]
Modelo Holliday de rotura y amplificación del ADN reunión
(Un animación de la Universidad de Wisconsin)
mellar de hebras complementarias de emparejado ADN [IG1 1 4 .15]
monocatenario endonucleasas
desplazamiento de hebra [IG1 1 4 .1 6 ]
RecA proteína causas "salto de pista"
durante migración de ramas, H-Reforma de bonos entre hebras complementarias
heterodúplex formación y rotación del amplificador
Dos moléculas de dsDNA son unido covalentemente
Cytologica l chiasmata mostrar cromosoma rotura y reunión de amplificador [IG1 1 4 .1 2 ]
[cantar., quiasma: de Chi, una letra en forma de X]
resolución, mella y reunión de amperios [IG1 1 4 .17]
repararligadura) de mellas forma dos moléculas de ADN recombinante

La frecuencia de recombinación es proporcional a la distancia física entre los loci [IG1 Res Brief 15 .2, págs. 306-307]
Los loci desvinculados se reordenan al azar (50%) [IG1 1 4 .1 0 ]
Reordenamiento de loci enlazados & lt o & lt & lt 50%
Cruces con cis y amp trans las configuraciones producen resultados diferentes
Análisis de cruces dihíbridos ligados : Loci A y B (MGA2 6-10) (notas en PDF)
Análisis de cruces trihíbridos ligados : Loci E F y amp G (MGA2 6-12) (notas en PDF)
Determinación del orden de los genes: regla del "cambio"
Determinación de la frecuencia de recombinación: identificar &erio contar clases recombinantes
1 unidad de mapa (m.u.) = 1 centimorgan (cM) = 1% de recombinación
Corrección de eventos de doble recombinación (MGA2 6-13, 6-14)
Posibilidad de interferencia
Los mapas genéticos unen la genética clásica y la biología molecular (MGA2 6-Found2a) [IG1 15.20,21]
Mapas de enlace para la mosca del gusano barrenador, Drosophila y Solanum
Los loci enlazados separados por & gt50 cM muestran recombinación aleatoria

Los resultados de los cruces genéticos se pueden evaluar estadísticamente.
Ej .: ¿Las proporciones corresponden a predicciones genéticas?

[Prueba de bondad de ajuste de chi-cuadrado
grados de libertad
significancia estadística
Ex. : Prueba de proporciones observadas versus esperadas en cruces
Ej.: Prueba de ocurrencia de interferencia en cruces trihíbridos]

Tarea : Practica ejemplos de cruces trihíbridos [Copia en PDF]

Todo el material de texto y copy2012 por Steven M. Carr


Información del autor

Dirección actual: Dirección actual: Departamento de Patología, Facultad de Medicina de la Universidad de Stanford, Stanford, California, EE. UU., Y Departamento de Genética, Facultad de Medicina de la Universidad de Stanford, Stanford, California, EE. UU.,

Elin Grundberg, Kerrin S Small, Åsa K Hedman, Alexandra C Nica y Alfonso Buil: estos autores contribuyeron igualmente a este trabajo.

Afiliaciones

Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton, Reino Unido

Elin Grundberg, Kerrin S Small, Tsun-Po Yang, Eshwar Meduri, James Nisbett, Magdalena Sekowska, Alicja Wilk, So-Youn Shin, Catherine Ingle, Leopold Parts, Simon Potter, Loukia Tsaprouni, Richard Durbin, Nicole Soranzo y Panos Deloukas

Departamento de Investigación de Gemelos y Epidemiología Genética, King's College London, Londres, Reino Unido

Elin Grundberg, Kerrin S Small, Jordana T Bell, Eshwar Meduri, Daniel Glass, Gabriela Surdulescu, Veronique Bataille, Kourosh R Ahmadi & amp Tim D Spector

Wellcome Trust Centre for Human Genetics, Universidad de Oxford, Oxford, Reino Unido

Åsa K Hedman, Sarah Keildson, Jordana T Bell, Josine L Min, Cecilia M Lindgren, Krina T Zondervan y Mark I McCarthy

Departamento de Medicina Genética y Desarrollo, Facultad de Medicina de la Universidad de Ginebra, Ginebra, Suiza

Alexandra C Nica, Alfonso Buil, Antigone S Dimas, Stephen B Montgomery y Emmanouil T Dermitzakis

Instituto de Genética y Genómica en Ginebra, Universidad de Ginebra, Ginebra, Suiza

Alexandra C Nica, Alfonso Buil, Antigone S Dimas, Stephen B Montgomery y Emmanouil T Dermitzakis

Centro Oxford de Diabetes, Endocrinología y Metabolismo, Universidad de Oxford, Hospital Churchill, Oxford, Reino Unido

Amy Barrett, Mary Travers, Neelam Hassanali y Mark I McCarthy

Centro de Análisis Causal en Epidemiología Traslacional (CAiTE) del Consejo de Investigación Médica (MRC), Facultad de Medicina Social y Comunitaria, Universidad de Bristol, Bristol, Reino Unido

Sue Ring, Karen Ho y George Davey Smith

deCODE genetics, Reykjavik, Iceland

Gudmar Thorleifsson, Augustine Kong, Unnur Thorsteindottir y Kari Stefansson

Facultad de Medicina, Universidad de Islandia, Reykjavík, Islandia

Unnur Thorsteindottir y amp Kari Stefansson

Departamento de Informática, Facultad de Ciencias Naturales y Matemáticas, King's College London, Londres, Reino Unido

Chrysanthi Ainali y Sophia Tsoka

Departamento de Ingeniería, Universidad de Cambridge, Cambridge, Reino Unido

Instituto Europeo de Bioinformática, Hinxton, Reino Unido

Laboratorios de Investigación Metabólica de la Universidad de Cambridge, Instituto de Ciencia Metabólica, Hospital Addenbrooke, Cambridge, Reino Unido

Christopher E Lowe y Stephen O'Rahilly

Centro de Investigación Biomédica del Instituto Nacional de Investigación en Salud de Cambridge (NIHR), Hospital de Addenbrooke, Cambridge, Reino Unido

Christopher E Lowe y Stephen O'Rahilly

St. John's Institute of Dermatology, King's College London, Londres, Reino Unido

Paola Di Meglio y Frank O Nestle

Departamento de Genética y Ciencias Genómicas, Escuela de Medicina Mount Sinai, Nueva York, Nueva York, EE. UU.

Centro de Investigación Biomédica NIHR de Oxford, Hospital Churchill, Oxford, Reino Unido

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Consorcios

El Consorcio de Recursos de Expresión Humana de Tejidos Múltiples (MuTHER)

Contribuciones

K.R.A., M.I.M., P.D., E.T.D. y T.D.S. concibió el estudio. E.G., K.S.S., Å.K.H., A.C.N., A. Buil y S.K. datos analizados. T.-P.Y., E.M., S.-Y.S., J.L.M., K.T.Z., S.R., K.H., G.T., A.K., U.T., S.P., N.S., E.E.S., K.S. y G.D.S. reactivos, materiales o herramientas de análisis aportados. A. Barrett, J.N., M.S., A.W., D.G., M.T., N.H., C.I., M.K. y G.S. realizaron experimentos de laboratorio húmedo o recolectaron muestras. J.T.B., C.A., A.S.D., D.K., C.E.L., P.D.M., S.B.M., L.P., L.T., S.T., V.B., R.D., F.O.N., S.O. y C.M.L. contribuyó con el apoyo técnico y experimental, así como con la discusión. P.EJ. preparó el manuscrito, con contribuciones de K.S.S., Å.K.H., A.C.N., A. Buil, M.I.M., P.D., E.T.D. y T.D.S. Todos los autores leyeron y aprobaron el manuscrito.

Autores correspondientes


Ejercicios de revisión de conceptos

¿Qué son los isómeros cis-trans (geométricos)? ¿Qué dos tipos de compuestos pueden exhibir isomería cis-trans?

Clasifique cada compuesto como isómero cis, isómero trans o ninguno.


5.17: Estereoquímica en Octaedros: Cis vs Trans y Fac vs Mer

  • Contribuido por Kate Graham
  • Assoc. Profesor (Química) en College of Saint Benedict / Saint John's University

Nota: Esta página muestra ejemplos de complejos de coordinación, en los que varios grupos llamados "ligandos" se unen a un átomo o ión metálico central. Para obtener más información sobre estos complejos, consulte la breve introducción aquí.

Anteriormente, analizamos los isómeros cis y trans en complejos de platino planos cuadrados. Otros complejos de metales de transición muestran isomería cis-trans. Los complejos octaédricos también pueden tener dos ligandos particulares adyacentes entre sí o en lados opuestos del átomo metálico. Por ejemplo, el catión [(NH3)4CoCl2] + tiene un isómero cis y un isómero trans.

Figura SC17.1. Cis- y trans-isómeros de un compuesto de cobalto octaédrico.

Dibujar cis y trans isómeros para los siguientes compuestos.

Cis y trans los isómeros se encuentran cuando hay dos ligandos cuya relación espacial se puede describir fácilmente como "uno al lado del otro" o "entre sí". ¿Qué pasa si hay más de dos ligandos que pueden adoptar diferentes disposiciones geométricas alrededor de un metal?

Un ejemplo se encuentra en el complejo Co (NH3)3Cl3. En ese compuesto, que tiene una geometría octaédrica, los tres cloro pueden encontrarse todos en una fila, o pueden encontrarse agrupados en un triángulo. Cuando se encuentran tres ligandos en una fila en un octaedro, la geometría se llama & quotmeridional& quot o simplemente & quotmer& quot. Cuando los tres se agrupan en un triángulo, la relación geométrica se llama & quotfacial& quot o simplemente & quotfac& quot.

Figura SC17.2. los fac- y mer- configuraciones de (NH3)3CoCl3.

los fac La designación se deriva de la ubicación de los tres ligandos cuyas posiciones se están comparando: todos se encuentran a lo largo de uno de los caras de un octaedro.

Figura SC17.3. Ilustración de una relación facial en un octaedro.

La designación mer proviene del hecho de que los tres ligandos se encuentran a lo largo de un meridiano. Un meridiano es simplemente una línea desde un vértice del compuesto hasta el vértice opuesto. Es como un meridiano en la tierra, desde el polo norte al polo sur.

Figura SC17.4. Ilustración de un meridiano a lo largo de un octaedro.

Dibujar fac y mer isómeros de los siguientes compuestos.

a) RhCl3py3 (py es un anillo de seis miembros con cinco carbonos y un nitrógeno)

Algunos de los compuestos de esta página demuestran otro tipo de isomería. Se denomina isomería de enlace e implica cuál de los átomos del ligando está conectado al metal. Por ejemplo, los átomos en cada extremo de un ion tiocianato, SCN -, ambos tienen pares solitarios. Uno u otro podría unirse a un metal en diferentes circunstancias. El azufre podría estar unido al metal, o bien podría ser el nitrógeno. Estas dos opciones forman dos isómeros de enlace diferentes.

A menudo, para comunicar de qué isómero de enlace estamos hablando, el isómero deseado se indica colocando el átomo unido al metal primero en la fórmula del compuesto. Por ejemplo, escribiendo la fórmula [Co (OH2)4(SCN)2] + sugiere el isómero en el que el azufre se une al cobalto. Escribiendo la fórmula [Co (OH2)4(NCS)2] + sugiere que el nitrógeno está unido al cobalto.


Bonos dobles cis y trans

En sus usos más comunes, que son también los usos más simples, el prefijo cis significa mismo y el prefijo trans significa a través de. Especialmente es esto en referencia a un doble enlace. Tome nota del ejemplo proporcionado en la imagen de arriba.

Después de mirarlo, alguien podría decir: "¿Pero no hay cuatro 2-butenos diferentes, en lugar de solo los dos que se muestran en la imagen, el cis y el trans?

No no hay. Voltea los dos dibujados de arriba a abajo o de izquierda a derecha y pueden parecer diferentes. Pero en un examen más detenido, es evidente que son lo mismo, cis-2- y trans-2- buteno.


Existen muchas diferencias en las propiedades físicas de los isómeros cis y trans. Los cisisómeros tienden a tener puntos de ebullición más altos que sus contrapartes trans. Los isómeros trans generalmente tienen puntos de fusión más bajos y densidades más bajas que sus contrapartes cis. Los cisisómeros recogen la carga en un lado de la molécula, lo que le da a la molécula un efecto polar general. Los transisómeros equilibran los dipolos individuales y tienen una tendencia no polar.


Ver el vídeo: NOMENCLATURA CIS TRANS (Enero 2022).